Conceptul de ancorare magnetică ia în considerare natura magnetică a vortexului. Astfel, în acest caz forța de ancorare este datorată interacțiunii atractive dintre câmpul magnetic generat în jurul nanoincluziunii magnetice (centrul de magnetic de ancoraj) şi momentul magnetic al vortexului. Forța de ancoraj este proporțională cu gradientul magnetizării . Din aceasta cauză pentru a produce forţe de ancorare eficiente este necesar să existe gradienți de câmp mari în vecinătatea vortexului. Acest deziderat poate fi atins în doua moduri: (1) prin folosirea gradientului intrinsec al magnetizării care apare la limita pereţilor Bloch a unui film feromagnetic depus pe suprafața filmului supraconductor şi (2) introducerea în matricea supraconductoare a unor nanoincluziuni feromagnetice care, din cauza dimensiunilor lor reduse, generează în vecinătatea lor un gradient al magnetizării foarte mare. Interesul deosebit pentru ancorarea magnetică în YBCO este justificat de faptul că acest material este cel mai utilizat la fabricarea cablurilor/benzilor supraconductoare de temperatură înaltă.